造成儿童发热、头疼的原因主要包括以下几个：1、由于儿童患有感冒引起，如果儿童感冒，尤其是患有流行性感冒，儿童往往会出现发热，并伴有头疼，甚至儿童还会出现恶心、恶寒、呕吐等症状，可以给儿童及时进行抗感冒治疗，比如可以给儿童应用奥司他韦或者蓝芩口服液等。2、由于儿童患有脑炎引起，如果儿童患有病毒性脑炎或者细菌性脑炎，都会引起儿童颅内压增高，从而造成儿童头痛，因为脑炎是由炎症引起，往往会引起儿童出现发热。针对于儿童的脑炎，需要及时进行抗感染以及降颅压治疗。