小儿高烧39℃时，退烧方法有药物退烧和物理降温。当小儿体温超过38.5℃时，就可以口服退烧药，比如布洛芬口服液或对乙酰氨基酚等。同时还可以用物理降温，具体办法是使用温水擦拭患儿的手心、脚心、额部、颞部和大腿根部，或用75%的医用酒精兑成25%-50%的酒精擦浴，还可以用退热贴贴在宝宝的额头上降温。另外，还要注意室内的温度不要太闷热，室内要保持安静，不要有大的震动。孩子高热时遇到大的响动，有诱发热惊厥的可能。
小儿高烧39℃时，还要查血常规，看看是细菌感染，还是病毒感染，或者支原体感染。如果是细菌感染，可以吃抗细菌感染的药物，如头孢克肟、阿莫西林等抗菌药物。如病毒感染可以用抗病毒的药，如利巴韦林颗粒、抗病毒口服液等。支原体感染时，口服阿奇霉素效果很好，还可以口服中药，如小儿豉翘清热颗粒等等。小孩高烧时服药，应在医生的指导下服用。