心脏造影剂主要的不良反应有胃肠道反应、损伤肾功能，以及过敏的可能。普遍来说心脏造影剂选取的主要为含碘的造影剂，通常情况下含碘造影剂产生副作用的几率很小，主要分为过敏、肾损害以及胃肠道反应。
含碘造影剂会使皮肤产生过敏反应，症状较轻的有颜面部、躯干部的皮肤瘙痒、发红，有的还可能产生皮疹，主要是因为皮肤不能耐受导致碘过敏。含碘造影剂主要是由肾脏排出，造影剂可以使血管收缩，使肾血管血流的阻力增加致使肾脏缺氧，导致肾衰竭。
含碘的造影剂还可以导致恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道反应，主要是因为胃肠道对于碘造影剂的过敏导致的腹痛、腹泻等胃肠道症状。