导致尿路感染反反复复的原因大体上可以分为以下几项：
1、诱因并没有完全去除：其诱因包括解剖上的原因，比如由于患者天生解剖上的问题导致尿液引流不畅，容易引起感染。这些问题在没有得到根治之前，尿路感染会反反复复发作。还有患者有泌尿系统结石，结石也促进了感染的发生，二者互相促进。个别患者存在着泌尿系统和其他系统，比如消化道系统的瘘，因为瘘的存在使泌尿系统的无菌环境受到了破坏，就会反复发生尿路感染。还有一种特殊的病变是女性的尿道外口，有部分人可以跟阴道口离得很近，会导致反复发生尿路感染。
2、自身免疫力下降：比如糖尿病患者、艾滋病患者等，上述患者身体免疫力比较差，对抵抗细菌的能力也比较差，容易反反复复发生感染，而此类患者很多情况下原发病控制不好，或者是无法控制，使得感染不能够很好的解决。
3、病原菌并没有完全消灭：某些细菌经过反复用药之后产生了耐药，耐药菌如果没有经过足够疗程，而且合理的抗生素治疗，没有完全被消灭，使致病菌在泌尿系统长期存在，就会导致尿路感染反复发作，有时细菌甚至会发生变异，导致治疗更加困难，也是尿路感染经久不愈的原因。