肠穿孔分为小肠穿孔和大肠穿孔，如果是小肠穿孔，一般不会危及到患者生命。因为小肠内的细菌比较少，小肠发生穿孔以后，腹腔的污染相对比较轻。除了肠液以及消化液渗透到腹腔以后引起急性弥漫性腹膜炎、腹部疼痛比较明显之外，在手术时将肠穿孔进行修补，将腹腔内的液体进行清洗、腹腔放置引流即可。如果肠穿孔的范围比较大，可能要将穿孔部位的小肠进行切除，两端肠管进行吻合，手术以后抗感染治疗，一般不会危及生命。
如果穿孔时间太长，好几天甚至于一周多时间，可能会影响到患者的生命。如果是大肠发生穿孔，腹腔感染比较轻的情况下，常规行肠造瘘手术，一般不会危及患者的生命。如果大肠穿孔时间非常长，腹腔污染比较重，形成粪石性的腹膜炎，严重的脓毒败血症的时候，可能会危及患者的生命。