坐骨结节囊肿手术的风险具体如下：
第一、坐骨结节囊肿手术采取局部切开将囊肿切除，由于手术比较接近坐骨神经，所以在切除囊肿的时候有一定的几率会损伤到坐骨神经，从而引起下肢坐骨神经损伤的症状，包括下肢放射性疼痛、下肢麻木或者足部肌力、踝部肌力的下降、关节活动度下降。
第二、因为坐骨结节囊肿是在臀区离肛门较近，手术切口较易受到污染，术后有可能会存在切口感染，切口愈合不良的情况。