盐酸吗啡主要是具有镇痛的作用。它是阿片受体激动剂，具有强大的镇痛作用，同时也具有明显的镇静作用，并且还具有一定的镇咳作用。
但是，由于它具有比较强的成瘾性，因此一般镇咳和镇静是不使用这个药物的。盐酸吗啡对呼吸中枢具有抑制作用，能够使二氧化碳的张力反应性降低，过量可能会导致呼吸衰竭而死亡。
另外，它还能够兴奋平滑肌，增加肠道平滑肌的张力而引起便秘，并且可以使胆道、输尿管、支气管平滑肌的张力增加，也可以使外周血管扩张，具有缩瞳、镇吐等作用。
在临床上盐酸吗啡它主要的是作为强效的镇痛药，可以适用于其它镇痛药无效的急性剧痛，比如严重的创伤、战伤、烧伤、晚期癌症疼痛。总之，盐酸吗啡主要是具有强效的镇痛作用。