格林巴利综合征发病情况不同，预后也不同。可分为急性发病、亚急性发病和慢性复发性起病。急性和亚急性发病者85％，在1-3年完全恢复，约10％的患者遗留有长期后遗症。老年患者、有严重神经轴突变性、辅助呼吸时间超过1个月，或进展快且伴有严重自主神经功能者预后不良。约3％的患者可能出现1次以上的复发，复发间隔时间可数月至数十年。