女性过早闭经的原因主要是卵巢功能过早衰退，卵巢功能过早衰退的常见病因是遗传因素，有些患者发生染色体异常和基因突变，就有可能会出现卵巢早衰，在40岁之前出现闭经。另外还有医源性因素，可能会造成女性过早闭经，例如手术或者放疗、化疗。如果进行卵巢手术，在手术过程中可能会引起卵巢组织的缺损或者局部炎症，在术后有可能会出现卵巢功能过早衰退。另外放疗和化疗都可能会诱导卵母细胞凋亡，破坏颗粒细胞的功能使卵巢功能过早出现衰退。还有特殊的原因可能会造成卵巢功能过早衰退，例如自身免疫失调、不良的生活环境、生活方式或者抽烟、酗酒等，有可能会影响卵巢功能出现过早的闭经。还有其它方面的原因可能会造成这种情况，例如垂体的原因，常见的是席汉氏综合征，还有垂体肿瘤等。另外子宫性的原因可能会造成过早闭经，例如Asherman综合征，在多次人工流产之后导致子宫内膜过度损伤而出现的闭经，造成女性过早闭经的原因非常多，需要进行相关的检查之后才能够明确。