十二指肠溃疡典型的症状是上腹部疼痛，临床上可表现为上腹部隐痛、钝痛、刀割样疼痛，或尖锐样疼痛等。疼痛的特点主要有长期性，患者可以有数年到数十年的病史，餐后疼痛缓解，餐前疼痛明显。
十二指肠溃疡的患者在进餐前疼痛明显，进餐后可立马缓解。有夜间痛，十二指肠溃疡的患者可出现睡前疼痛，或在睡觉中出现疼痛。十二指肠溃疡患者疼痛具有周期性，主要表现为春秋季易发，天冷、天热、温差变化较大时疼痛明显。十二指肠溃疡的疼痛特点是用了奥美拉唑以后，症状可以缓解。