眼睛脓肿是否会自愈，很大程度上不可能自愈，如果脓肿不去医院做切开引流，脓肿会自己穿破皮肤破溃，破溃口不会太大，所以脓的流出不会太彻底。
破了小口出一点脓破口又自然闭合，闭合以后脓会继续的恶化、生长再出现破口，长此以往脓肿可能吸收，但是会留下疤痕，疤痕有的时候会形成硬硬的疙瘩，叫组织的瘢痕化，其实是不可取的。
有脓肿尽量及时医院去做切开引流，把脓引流出来，让脓肿得的彻底的恢复和治愈。