早上起来咳嗽往往见于呼吸系统炎症，如上呼吸道感染、咽喉炎、支气管炎、肺炎、肺结核等等情况。如果是考虑炎症性疾病，可给予抗炎及止咳化痰等等治疗，如可服用头孢地尼或者阿莫西林抗炎，以及苏黄止咳胶囊或者盐酸氨溴索分散片止咳化痰治疗。
如果效果不佳或者患者病史较长，可到医院去拍胸片或者做胸部CT等等检查，进一步明确肺部是否有其他的疾病。如果还是考虑炎症，则需加强抗炎治疗。如果是有结核性疾病，则需要给予抗结核等治疗。如果还有其他的病因，需要针对病因进行治疗，咳嗽症状才能好转。