宫腔镜检查时将检查镜头通过阴道和宫颈置于宫腔内，是单纯的检查，没有危害。但是，如果操作不当或者需要进一步检查，则有可能引起危害。宫腔镜检查治疗的损伤有以下几点：
第一、出血、穿孔，如果术前检查未查清子宫位置，取镜时可能穿孔。
第二、宫腔镜检查和治疗的手术时间长，输液速度过快会出现水过度综合征，即水中毒，出现血压下降、呼吸困难、心衰，甚至死亡，这种现象比较少见。
第三、有可能会出现空气的栓塞，因而医生治疗时要需要把水排干净，预防空气的栓塞。
第四、有可能导致阴道炎逆行感染，跟随器械从阴道上行至宫腔内，但是这是极少数情况，相对于妇科疾病的诊断和治疗，收益大于风险。