早上空腹艾灸会导致低血糖发作，长期下去容易诱发胃部疾病。艾灸主要是调理人体阴阳平衡，提高人体免疫力，以达到治愈疾病的作用。艾灸对于时间没有特殊的要求，但是在艾灸时，最好是尽量避免在早上空腹的状态下。在空腹的状态下，人体会存在有血糖偏低现象，这时进行艾灸会导致身体燥热，甚至部分人还会出现头晕、恶心症状。
空腹时人体会处于饥饿感的状态下，而艾灸持续一段时间，这时会导致空腹的状态持续时间比较长，长期下去会更容易诱发胃炎、胃溃疡等疾病。在选择艾灸时间上，最好是尽量选择在饭后半小时，这样对于艾灸效果不会造成影响，同时对人体健康也不会造成影响。