艾滋患儿在10-12个月左右可发病，其中80%以上在3岁前出现症状，典型的HIV在临床经过包括急性感染期即窗口期，潜伏期即无症状期和晚期艾滋病期。
多数HIV感染新生儿出生时临床和免疫学显示正常，少数可以有肝脾大和淋巴结病，也可有低体重和各种先天的畸形，如小头畸形、鼻梁塌陷、短鼻子、眼距增宽、眼裂缩小或前额呈方形等等。
从暴露于HIV-临床发作为10-12个月，其中80%以上在3岁前出现症状，有早期症状的婴幼儿病程进展极为快速，卡氏肺孢子虫肺炎是3-6个月HIV感染婴幼儿最常见的严重的并发症，为死亡的主要病因。