拔除双J管时会有一定疼痛感，在拔管过程中患者可能会突然感到腰痛，持续时间很短，拔管后疼痛消失。
拔双J管时需要使用膀胱镜拔除，在运用膀胱镜过程中会出现尿道内疼痛，多采用局部麻醉或者尿道表面麻醉进入膀胱镜。当膀胱镜进入膀胱后，看到膀胱内双J管末端，在镜下使用异物钳夹住末端，再将体内双J管拔出体外。在此过程中患者会突然觉得短暂剧烈的腰痛，大约持续3-5秒之后，随着管道完全拔出，疼痛立即消失。管道拔除以后膀胱镜也会退出尿道，尿道内的疼痛也会消失。如果患者配合良好，此过程可能只需要1-2分钟就可以完成。
患者拔管过程通常可以耐受，管道拔除以后不会再产生任何其他的痛苦，如果觉得疼痛或者害怕，可以在静脉全麻下拔管。拔管后服用抗生素控制感染，并注意多饮水，减轻尿道刺激症状。