婴儿抵抗力差，慢性肠炎一般不能自愈。慢性肠炎是由于急性肠炎没有及时治疗导致，婴儿肠炎是由细菌或病毒感染引起。病毒性肠炎是自限性疾病，如果婴儿抵抗力强，可以自愈。如果婴儿抵抗力弱，同时伴有脱水、酸中毒，及电解质紊乱的情况，要及时去医院就诊，给予补液，纠正酸中毒及电解质紊乱。
对于细菌性肠炎，自愈的可能性很少，必须给予抗生素消炎治疗，部分家长认为孩子小不愿意应用抗生素，结果治疗不及时，最后发展为慢性肠炎，迁延不愈，损伤肠道功能，影响生长发育。