一般引起儿童喉咙有疱疹且反复发烧的原因，主要由于感染引起，比如儿童患有肠道病毒、柯萨奇病毒或者EV71病毒感染以后，就会引起儿童出现疱疹性咽峡炎。
此时儿童会有喉咙中疱疹，并且咽喉疼痛非常剧烈、流口水、厌食等一系列症状，甚至中毒症状比较重还会引起发热。由于儿童的感染程度比较厉害就会反复发烧，此时应及时进行抗病毒处理，比如应用清热解毒的蓝芩口服液或者蒲地蓝消炎口服液。