肚皮针预防血栓，主要是在肚皮的皮下注射低分子肝素，低分子肝素的作用主要与抗凝血酶Ⅲ型结合，使抗凝血酶Ⅲ的构型发生改变，它的活性成分暴露与凝血因子相结合，抑制凝血因子，所以抗凝血酶Ⅲ可以和凝血酶形成复合物，使凝血酶的作用减弱。
凝血酶的作用主要是将纤维蛋白原变成纤维蛋白，所以人体形成的纤维蛋白通过肝素的作用就会减少，凝血时间就会延长，所以能够起到预防血栓进一步发展的作用，同时肝素也有少量的抑制血小板聚集的作用。