经期不建议同房，会增加感染的可能，也增加痛经和子宫内膜异位症的发生。经血是细菌培养基，同房容易导致感染，而且经期宫颈管开放，感染容易逆行通过宫颈管进入宫腔，甚至进入盆腔引发盆腔炎，严重的或者反复发作的盆腔炎会损伤输卵管黏膜，对以后的生育功能造成影响。
同房也容易产生宫缩，宫缩会刺激痛经的发生，而且宫缩会增加宫腔压力，增加经血逆流。逆流的经血如果种植在卵巢表面或者盆腔腹膜表面，会增加子宫内膜异位症的发生，而子宫内膜异位症是痛经和不孕的重要原因。