肛周有肉芽，最常见的原因是肛瘘外口。肛瘘外口呈肉芽状隆起，会出现外口反复流脓，肛周也会出现反复肿痛。肛瘘的治疗原则即手术，只有手术才能完全治愈肛瘘，其它用药辅助治疗只能控制肛瘘症状。肛裂也会导致肛门肉芽，肛裂的裂口由于反复的炎症刺激，会导致裂口外面肉芽炎性增生。可局部使用太宁栓塞肛门，外用马应龙痔疮膏促进肛裂裂口愈合，局部炎症控制后肉芽也会有所缩小。如果没有临床症状的，不需要特殊的治疗。肛门周围尖锐湿疣，有时也会呈肉芽状赘生物。尖锐湿疣是由于HPV病毒感染，所导致的性传播疾病。需去医院行激光或冷冻去除肉芽疣体，配合干扰素等外用药膏的使用，控制其复发。