偶尔一次灌肠无大碍，频繁灌肠会导致患者出现局部感染、肠道黏膜受损、肠易激综合征等表现，灌肠是临床上常用的方法，偶尔一次灌肠不会对身体造成影响，但是部分人由于反复灌肠，容易导致局部出现感染，也可能在灌肠时用力过大，导致穿孔的出现。
另外，反复灌肠还会对肠道的黏膜造成刺激，导致黏膜受损，甚至会出现局部水肿、充血等表现，由于经常灌肠，可能导致肠道刺激反应减弱，自主蠕动功能减弱，不利于便秘患者的恢复，同时患者本身就存在肠易激综合征等疾病时，在灌肠时动作太猛，还会导致患者肠易激综合征复发，所以想要灌肠的患者，应避免频繁使用此种方法。