γ-谷氨酰转移酶偏高，最常见的原因是肝、胆、胰腺的疾病，以及其他部位，如心肌梗死、前列腺肿瘤等。此外，一些药物的使用，如抗惊厥药苯妥英钠、镇定剂或者乙醇，也常会导致γ-谷氨酰转移酶的升高。
最常见的是肝胆疾病，其对于梗阻性黄疸、胆囊炎、胆管炎是敏感性比较高，而急性肝炎、药物中毒、脂肪肝、酒精肝的患者，γ-谷氨酰转移酶都会出现升高。针对肝硬化、肝癌的患者，也有可能会升高，所以需要进一步的详细检查，确定其真正的病因。此外，急慢性胰腺炎也有可能会导致γ-谷氨酰转移酶的升高。