米索前列醇用于停经49天以内的宫内妊娠药物流产，一般是和米非司酮片合并使用。在服用米索前列醇片半个小时内，一般会出现强烈的腹痛，有的患者会有阴道少量出血，有的时候会有大量的血块和绒毛样组织排出，还有的患者会出现其他的并发症，有的有严重的恶心、呕吐、腹泻、手足心发热、皮疹和寒颤等不良反应，一般出现的绝大多数反应不需要处理，一般十几分钟会好转。
另外，一般在服用米索前列醇之后的六个小时以内会排出妊娠囊组织，上厕所的时候需要用盆接住，以免妊娠物掉入厕所无法观察。如果流血量过多，超过七天还需要去医院复诊。流产后两周患者应做B超检查看是否完全排出，如果有妊娠物残留，需要及时进行清宫手术。