体外碎石以后的疼痛主要的原因可能有以下几种：
1、排石所造成的疼痛：这种疼痛发生的性质类似于结石的肾绞痛发作，在结石排出的过程当中，输尿管壁受了刺激而造成的疼痛。其处理类似于结石的药物治疗，并同时嘱患者多饮水，增加活动，来促进结石碎块的排出。
2、积水：考虑由于结石的碎块梗阻而造成的积水，这种积水可能造成患者出现腰部的明显疼痛。通常可以根据影像学检查来明确诊断，必要的时候置入双J管，促进积水的缓解，减轻疼痛，同时促进结石排出。
3、血肿：考虑存在有局部损伤而造成的血肿，对于这种可以根据损伤的程度，采用保守治疗或者手术引流，甚至肾切除手术。