石头翁鱼的功效主要是益气补血、健脾开胃，临床当中可以辅助用来治疗体质虚弱、血虚引发的头晕、气短、乏力、饮食减少，包括一定程度上的营养不良。
因为鱼肉当中含有丰富的矿物质，有一定抗氧化能力，特别是在预防肝病方面，在一定程度上能够降低肝癌的发病率。鱼肉当中脂肪含量不是特别高，有助于脑部的发育，能够提高智力。
鱼肉还能预防心血管疾病，可以降低血压和血脂，能够有效预防高血压病、冠心病、心绞痛，乃至心肌梗死。
鱼肉当中含有丰富的不饱和脂肪酸，能够降低血液当中的胆固醇，在临床上可以辅助治疗白血病、胃癌，包括一部分淋巴结的肿瘤。