龟头化脓不能够应用百多邦软膏，因为百多邦软膏主要的成分是莫匹罗星。
莫匹罗星主要是针对革兰氏阳性菌有很强的抗菌活性，用于脓疱症或毛囊炎，主要的使用部位是在皮肤，百多邦软膏不能够应用在黏膜的部位。
返观龟头炎或者龟头化脓，病菌主要是大肠杆菌或霉菌，大肠杆菌属于革兰氏阴性菌，所以很多患者在应用了百多邦软膏之后，不但效果不好，在龟头表面还会出现烧灼感、刺痛感或者红肿，甚至有进一步的过敏症状出现。
主要是因为百多邦软膏不能够应用在黏膜表面，龟头表面覆盖着一层上皮黏膜。