胆汁反流性胃炎在治疗上是以促进胃动力恢复的药物为主，同时结合胃黏膜保护剂、抑制胃酸分泌的药物进行治疗，对于存在有幽门螺杆菌感染的患者，还应当根除幽门螺杆菌。胆汁反流性胃炎主要是因为胃、幽门、十二指肠的运动存在有紊乱现象导致的，会导致十二指肠中的胆汁反流进入胃内，从而对胃黏膜造成损坏诱发胃炎的发作。
因此，在治疗上首先需要协调患者的胃动力恢复，可以使用多潘立酮、胃复安、莫沙必利之类的药物进行治疗。随着消化系统的功能恢复，胆汁反流的现象就可以得到改善，同时还可以根据患者的胃部具体状况选择其他的药物，比如存在有胃黏膜损坏的患者，可以使用胃黏膜保护剂，比如胶体果胶铋、枸橼酸铋钾等。对于存在有胃酸分泌过多的人，可以使用抑制胃酸分泌的药物，比如法莫替丁、雷尼替丁，胆汁反流性胃炎反复发作，与存在有幽门螺杆菌感染有关，需要进行碳呼气检查确诊。对于存在有幽门螺杆菌感染的患者，应使用三联疗法或四联疗法进行根除，以达到减少疾病反复发作的目的。