肺结核用药常见的后遗症包括肝功能损害、肾功能损害、视神经损害以及周围神经病变，不同的后遗症处理方式不同，肝功能损害最为常见。
如果是单纯的转氨酶升高，可加用保肝的药物，例如水飞蓟宾、易善复等。
如果患者出现胆红素的升高，需要停用肝功能损害的药物，如果患者出现周围神经病变，可口服甲钴胺、维生素B1、维生素B12，用以营养神经，必要时停用导致周围神经病变的药物。
如果患者出现肾功能损害、视神经损害，需要停用相关的药物，当患者服用抗结核药物时，需要注意监测药物的副反应，并做出针对性的处理。