三个月不来月经，要看患者的年龄，是否结婚、是否伴有其他疾病，有没有服用不来月经的药物等等。育龄妇女如果三个月不来月经，先要除外妊娠，无论是宫内孕还是宫外孕都可以使得月经不来，这种情况做尿妊娠试验即可除外。另外，有一部分病人可能是因为下丘脑-垂体-卵巢轴的功能异常，造成的不来月经，可能会同时伴有肥胖、不孕等等，这些病人需要进行B超检查和血液的激素测定来了解卵巢功能。
还有一部分人是因为药物因素导致，比如服用免疫抑制剂或者是激素，或者是其他疾病需要化放疗时，使得卵巢功能受抑制，造成的不来月经。当然，还有一部分人因为年龄因素造成的卵巢功能减退，这时候也可能不来月经。总之，三个月不来月经到底是什么原因，要根据病人的情况来辨别，找出原因才能进行相应的治疗。