做胃镜虽然是有创伤的检查，但是胃镜的检查伤害并不是特别大。因为胃镜只是经过咽喉部进入到食道，然后观察贲门口、胃腔、十二指肠各个部位的位置，有没有发现一些相关性的疾病。
胃镜的检查仅仅是对咽喉部有一定的刺激，可能在做胃镜的过程中，由于干呕导致的咽喉部的擦伤而导致恶心、呕吐，或者出现了贲门口括约肌的松弛而引起的出血的情况，而这种出血的量相对来讲比较少。做完胃镜的检查之后，有可能咽部有一些不适的感觉，这种情况再观察一天左右，基本上也能够达到临床的缓解。
对于无痛的胃镜检查，多数是需要静脉推注丙泊酚，患者整个过程是处在睡眠的状态下，这种对人体也是有一定的损伤，但是这种损伤经过代谢之后，观察6-8小时都能够达到明显的缓解。