男性病人发生衣原体和支原体阳性时常常会导致尿道炎的发生，病人会出现尿道发痒、尿道隐痛，还会出现尿道稀薄分泌物，部分病人会出现会阴部或下腹部隐痛的症状，少数病人会出现排精后尿道刺痛的症状。
通过精液支原体、衣原体培养常常能找到致病微生物，通过药敏试验可以选择有效的抗生素，通过选择盐酸多西环素、盐酸米诺环素、阿奇霉素分散片、左氧氟沙星等序贯治疗，多数病人衣原体、支原体阳性的症状会明显好转，检查衣原体、支原体时会转阴。