如果小便时龟头刺痛，考虑尿路的炎症，尤其是尿道口炎的可能性，这种情况有三种原因：
1、可能是性病，性病患者往往有不洁的性生活史，出现小便时龟头的疼痛，甚至有尿道口脓性的分泌物，一般考虑淋病和非淋的可能性。
2、包皮过长或者包茎，由于一直窝在这个地方，会引起尿道口的炎症，还有包皮垢的刺激，就会产生尿道口或者尿道里面的炎症，小便时就会有刺痛的表现。
3、前列腺炎，前列腺炎患者有尿频、尿急的症状，也会通过神经放射到龟头，形成刺痛。