宝宝脑炎是由细菌、病毒、真菌，或支原体等感染引起，病原体不同及病原体侵袭的范围程度不同，临床症状也不同。早期症状类似于普通感冒，如鼻塞、流涕、咽痛、腹泻、精神差、发热、头痛、呕吐、烦躁、哭闹等。
随着病情的进展出现神经系统的症状，如嗜睡、尖叫、喷射性呕吐、头痛加重、精神萎靡、意识障碍、颈项强直、惊厥、昏迷、呼吸不规则等。宝宝脑炎是神经系统的疾病之一，识别出脑炎的早期症状对于早期诊断及治疗很重要，是提高治愈率、减少并发症、改善预后的关键。