确定外耳道瘘管首先外耳道壁上有瘘口，从外耳道内的瘘口注入碘油进行造影，确定瘘口到达的部位。如果在里面存留则提示为瘘管，还可确定分支多少，确定后一般需行手术切除，切除时需注射美蓝作为标记。
术中顺着被美蓝染色的瘘管进行分离且最终将其切除。外耳道瘘管一般开口位于外耳道内且为盲管，一般为一个分支，但也有多分支存在，平时可自瘘口分泌出黏性分泌物，若伴有炎症可出现局部肿痛、压痛甚至脓肿的形成。