轻度眼肌无力的治疗方法主要是给予药物治疗，有少部分患者可给予胸腺治疗。
药物治疗包括胆碱酯酶抑制剂、肾上腺皮质激素和免疫抑制剂，胆碱酯酶抑制剂主要的作用是改善症状，溴吡斯的明是最常用的药物，也可使用溴化新斯的明治疗，肾上腺皮质激素可抑制自身免疫反应，适用于各种类型的肌无力。
如果肾上腺皮质激素不能应用、不耐受或者疗效不佳，可给予免疫抑制剂治疗，如硫唑嘌呤、环磷酰胺、环孢素A等。
胸腺治疗主要用于伴有胸腺肿瘤、胸腺增生以及药物治疗困难的患者，但对于18岁以下，既没有肿瘤，也无严重增生且病情不严重的患者，不采用此治疗方法。