肝内胆管结石引起疼痛，是多种原因所造成的结果。首先肝内胆管结石可以直接压迫胆管内壁，可以导致胆管的炎性狭窄。另外，在此基础上可以造成胆汁的引流不畅，容易引起胆管内狭窄。而反复的感染又会加重胆管的炎性狭窄，进一步发展可以出现化脓性胆管炎、肝脓肿以及胆道出血等。长期的结石刺激、炎症以及胆汁中的致癌物质，还可以导致肝内胆管出现癌变。这些原因都可以造成引起疼痛的感觉，临床上还需要根据具体的情况，选择不同的治疗策略，如果只是单纯的炎症造成的疼痛性病变，可以在选用敏感抗菌药物控制感染的基础上，取净结石，解除狭窄，通畅引流。如果已经出现癌变，还应当按照原发性肝癌的原则进行手术处理。