强直性脊柱炎的患者做CT检查，大多数需要做的是骶髂关节部位的CT检查，因为强直性脊柱炎患者大部分的疾病早期就可以出现骶髂关节的病理改变。最早的时候，使用的是骶髂关节的X线检查，但是骶髂关节是在骨盆位置，是呈现一个半躺状的S形状态，所以做X线检查的时候往往会出现影像的重叠，影响了对于疾病早期的判断。后来随着影像学水平的发展，骶髂关节的CT检查在强直性脊柱炎的诊断当中就占有重要地位了。
骶髂关节的CT同样是按照纽约的标准把病变得分为五级：
零级：指正常的骶髂关节。
一级：在CT下可以见到骶髂关节的骨质疏松、关节间隙的增宽，可以见到可疑的骨质侵袭和关节面的模糊。
二级：表现就是可以见到骶髂关节面的微小的破坏，关节边缘模糊，略微有硬化的表现，可以在骨皮质下见到微小的囊性变。
三级：表现为关节破坏和重现互见的表现，可以见到关节间隙明显的变窄、关节边缘模糊，可以看到非常明确的骨质的囊性变。另外，在关节的骶骨面和髂骨面的两侧都可以看到密度增高的硬化影。
四级：以关节面硬化为主，关节间隙可以大部分消失，甚至出现骶髂关节的关节融合或者强直。
在临床上，强直性脊柱炎的诊断以及病情的分期，不同的病情的病变破坏程度的估算，都是通过CT的影像表现来进行的。