男性不育通常要考虑做男性生殖系统的相关检查，包括体格检查、实验室检查或者影像学检查，通常体格检查主要是针对男性的睾丸、外生殖器，看看有无畸形。
针对男性不育的实验室检查，比较常用的如精液常规，精液常规可以明确是否存在着弱精、少精，甚至无精，以及精液是否液化的情况，还可以做染色体的检查。部分男性的雄性激素生殖检查也很有必要，影像学的检查，包括超声、CT、核磁等，必要时也需要做有创的内镜检查。