肺炎支原体和衣原体的感染可以出现典型的临床表现，例如高热、头痛、精神萎靡、刺激性干咳等。血常规白细胞一般是正常的，如果合并了细菌感染，可以出现白细胞的升高，支原体抗体在近期出现四倍以上升高，是确诊支原体感染的最主要依据，肺CT或胸片可提示间质性的改变。
确诊为支原体、衣原体感染后，需要使用相关的药物进行治疗，常用的药物包括了大环内酯类的阿奇霉素、红霉素，或者是喹诺酮类的左氧氟沙星、莫西沙星等，如果患者咳嗽较重，可多吃一些有润肺止咳作用的水果，例如苹果、梨等，而且平时要注意休息，避免受凉，多饮水，保持充足的睡眠。