流产出来的胚胎具体该怎样处理要根据胚胎的大小以及家属的要求而定。如果是怀孕三个月之前，流产出来的胚胎组织还只是一个孕囊还没有成型，或者是刚刚成型非常小的情况下，一般就会当做普通的医疗垃圾来处理。如果患者的胚胎已经比较大，已经成型的情况下，会与患者进行沟通。如果患者是想让医院来处理，医院则会集中进行火化处理。如果患者想自行处理，在签知情同意书的情况下，可以将胚胎的遗体带走，带走之后患者不能随便处理。需要根据情况进行火化或者是埋在地下，如果随便处理，是一种违法的行为，国家是不允许的。