核苷酸酶偏高也有可能是生理性因素所导致的。生理性因素引起的核苷酸酶偏高，没有临床症状，在去除诱因以后也可以恢复正常。而很多的肝脏病变也可以导致核苷酸酶偏高，既有可能是良性病变，也有可能是恶性肿瘤。
但是比较常见的是梗阻性黄疸、原发性肝癌以及各种急慢性肝炎等。临床上可以通过核苷酸酶，对于肝胆系统的疾病进行诊断和鉴别诊断。当然，当这些肝胆系统的疾病经过治疗缓解以后，核苷酸酶也有可能出现一定程度的下降，因此也可以用于病情恢复情况的评估。
不过核苷酸酶在临床上并不是常规的检查项目，通过碱性磷酸酶、转氨酶、谷氨酰转肽酶以及胆红素等基本检查项目，就可以满足对肝胆疾病的诊断。