扁平疣有的人是可以自愈的，但也有长期存在于皮肤表面的。因为扁平疣是HPV病毒感染引起的，有一定的传染性，搔抓后容易在扁平疣附近出现新的疣体，从而形成一连串的扁平疣。
如果不予治疗，单纯等待其自愈容易造成病灶扩散。对于扁平疣一般可以采取激光治疗、电离子或者液氮冷冻治疗，其中激光治疗效果会更理想。
如果实在不愿激光治疗，也不愿电离子冷冻治疗，也可以先局部外涂咪喹莫特乳膏或者干扰素凝胶、维A酸乳膏，可以帮助调节局部皮肤的免疫力，从而诱导扁平疣脱落，消散。平时注意不要喝酒，不要熬夜，也不要过度劳累，不要搔抓有扁平疣的皮肤以免扩散。