男性尿道感染衣原体是非淋菌性尿道炎，临床症状表现为尿频、尿急、尿痛、尿道刺痒，小便时有烧灼感，尿道口有稀薄白色分泌物，晨起尿道外口有糊状物粘敷，短裤有白色污渍。
严重时尿路刺激症状加重，刺痒向尿道深部发展，有时感觉会阴部尿道不适、刺痒胀痛、下腹酸胀、憋尿时痛、总有尿感，少有畏寒、发热。
诊断需要行尿常规、尿道衣原体酶联检测、PCR-RNA核酸扩张增检测，在明确诊断后予以大环内酯类，如阿奇霉素、美满霉素或喹诺酮类，如左氧氟沙星，抗感染治疗，女性性伴侣要同时治疗。