肛门总是不干净，最常见的主要是内痔、直肠脱垂和肛瘘等疾病引起，内痔患者发展至四期时，由于痔核脱出肛门外无法还纳，肛门闭锁不严，造成直肠内的黏液粪便渗出体外，从而出现肛门不洁的现象，直肠脱垂，尤其是外脱者，直肠壁脱出肛门外，也会导致肛门闭锁出现缝隙，大便、黏液渗出，肛瘘者以完全性肛瘘最为明显，直肠中的分泌物、粪便、黏液通过内口、瘘管、外口直接排出体外，出现肛门长期粪便污染的症状。此外，部分人群由于肛门括约肌无法完全控制肛门闭合，或者肛周湿疹患者本身局部分泌物增多，也会出现肛门部位长期有粪便或者潮湿不干净。