当牙洞发展到牙本质的时候，外部的刺激可以通过牙本质小管传递到牙髓内引起疼痛，如果没有剧烈的自发性疼痛，可以祛除掉龋坏组织，涂布树脂粘接剂，然后用复合树脂充填牙洞。当牙本质小管被封闭，牙洞被严密充填后，就不会有冷热刺激和食物嵌塞痛。
如果虫牙出现了剧烈的自发痛和夜间痛，说明已经发展到了牙髓炎，需要在局部麻醉下采用根管治疗的方式祛除腐坏牙体，打开牙髓腔，释放髓腔内的压力，失活牙神经，通过根管治疗疼痛就会消失。牙髓炎或者根尖周炎急性发作期也可以口服布洛芬、芬必得等止疼药，或者采用冷敷的方式缓解疼痛。