半夜恶心与十二指肠溃疡、幽门梗阻、肝炎疾病有关，十二指肠溃疡经常会在饥饿或者半夜的时候发作，发作时不仅会出现胃部疼痛、反酸等症状，部分患者还会因为胃壁痉挛而出现恶心、呕吐。幽门是胃内食物排进十二指肠的重要通道，一旦出现幽门梗阻，胃内食物在消化之后不能够正常排进到十二指肠，在胃中滞留。
幽门梗阻的患者白天摄入胃内的食物，由于不能够及时排进到十二指肠中，因此会在胃内腐熟、发酵，尤其到了晚上时会因为食物发酵对胃壁造成的刺激，从而出现恶心、呕吐。部分人在半夜恶心的同时还会伴有厌油腻、肝区部位不适症状，这种情况应警惕肝炎。患有肝炎疾病时，由于肝细胞受损，对食物的代谢功能受到影响，因此会出现恶心，伴有厌油腻、皮肤黄疸等症状。