三联活菌胶囊说明书未明确指出服药的具体时间，说明服药时间对药效影响不大，饭前吃或者饭后吃都是可以的。从服药最佳时间的角度考虑，需要具体问题具体分析。饭前服药的优点是可以减少食物对药物吸收的影响，提高药物的安全、稳定性，发挥药物的最佳功效。而饭后服药是为了减少药物对消化系统的刺激，减少胃肠道不良反应的发生。
三联活菌胶囊不良反应相对较少，但也有少数患者会出现腹痛、恶心、腹泻等消化道不良反应。出现胃肠道不良反应的患者或者脾胃功能较弱的患者，饭后服用会减少不良反应的发生。反之，饭前服药会更有利于药物的吸收，可以根据实际情况选择适合自己的服药时间。