肾功能不全失代偿期能保持10-20年左右，肾功能不全失代偿期肌酐值在178-442μmol/L，此期医学上目前无特效药物治疗，主要是延缓肾功能的进展、保护残余的肾功能、避免肾毒性药物的应用、控制血压、减少蛋白尿。蛋白尿大于1g/24h，血压控制在125/75mmHg，蛋白尿小于1g/24h，血压控制在130/80mmHg。选用保护肾功能、减少蛋白尿的降压药，如血管紧张素转化酶抑制剂和血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂，并注意其副作用，如干咳、高钾血症、肾功能下降。
若出现干咳不能耐受需停用，若出现高钾血症危及生命，需立即停用并降钾治疗，若出现肌酐两个月内升高大于30%需停用。慢性肾衰竭肾功能失代偿期呈慢性进行性进展，直至肾衰竭的终末期（尿毒症期），一旦出现尿毒症的症状就要进行肾脏替代治疗，如血液透析治疗或腹膜透析治疗。