扁桃体发炎大多数是细菌性感染，像对于这一类的细菌比较敏感的抗生素有头孢类、青霉素类，这些药物性相对比较敏感。也可以应用克林霉素或罗红霉素等药物治疗，这些是抗生素的种类。
另外，也可以加用强的松或者地塞米松等糖皮质激素类药物，可以改善症状、缩短病程。也可以加用中成药制剂，如清开灵颗粒等药物。而且还可以用盐水含漱，清淡饮食、多饮水对病情康复很有帮助。